Omvendt osmose anvendes til totalafsaltning af vand, da metoden filtreringsmæssigt kan tilbageholde bestanddele med en porestørrelse på mindre end 1 nm og dermed reducere mere end 98% af saltene. Det typiske arbejdstryk for et omvendt osmoseanlæg, der anvender drikkevand, er 12-16 bar.
Nanofiltrering anvendes derimod til målrettet at reducere uønskede bestanddele, både helt eller delvist. Til forskel fra omvendt osmose anvendes der ved nanofiltrering et lavere tryk, typisk under 7 bar, hvilket giver et lavere energiforbrug sammenlignet med et omvendt osmoseanlæg med samme ydelse.